眾所周知，日本是一個交通異常發達的國家，便利快捷高效的交通為日本本國人帶來了便利的同時也為游客們創造了很好的硬件設施，跟團游特別是自由行的游客，完全可以通過公共交通服務滿足大部分的出行需求，目前日本主要有電車（JR、城市地鐵、私營鐵路）、公交車和出租車組成。
1.巴士（公交車）
在日本，巴士（公交車）是火車、地鐵網絡之後的另一大公共交通工具，按照使用方式的不同，分為路線巴士、高速巴士、機場聯絡巴士、觀光巴士和接送巴士。無論是大城市還是中小城市，都有各種各樣的公司在運行定時的巴士路線，費用各不相同。行駛在各城市之間的高速公路巴士（高速巴士）無論是白天還是夜間都有很多車次，速度通常比急行列車慢一些，但價格要便宜20%—50%。乘坐巴士需要在停車站等車，巴士上顯示有路線號、終點站的名稱，巴士的側面有主要路線的介紹，乘車前務必要確認。
2.電車
在日本，電車的范圍非常廣，小到城市內的地下鐵系統，大到城市外圍及城際之間的火車都是電車。東京和大阪兩大城市都有日本鐵道集團營運的環狀鐵線路（東京：山手線、大阪：環狀線），以及多條以此為中心的線路。地鐵票在各個車站的自動售票機處就可以買到。日本地鐵管理嚴格，運行准時。一般站內換乘時間大概需要1～5分鐘，個別大站的換乘需要5分鐘以上。有的車站是同一站台內即可換乘，有的車站則必須再次通過檢票口才能換乘，乘坐的時候需要注意。
日本鐵路周游券（JR PASS）是日本鐵道集團發售的專為赴日觀光的旅游者准備的特別優待車票，對海外旅游者來說是非常劃算和方便的選擇。這種車票主要提供在某區域無限制的乘坐，或在某個指定區域往返乘坐加上無限制乘坐。目前日本鐵路周游券有一周、兩周、三周的規格。需要提醒的是，只有攜帶臨時旅游簽證在日本停留的外國人，以及在國外擁有永久住所的日本國民才有資格使用日本鐵路周游券。
3.出租車
日本的出租車很多，到處都能叫到。各地出租車的費用有一些差別，東京的起步價是660日元，而後根據距離和時間來加收車費，另外夜間乘坐是要加價的。乘坐街上流動的出租車只要舉手示意就可以了，車前擋風玻璃右下角處的顯示燈紅燈亮起“空車”時即為空車，顯示燈綠燈亮起“賃走”時表示已經載客。乘坐出租車時坐在後排座位是日本人的習慣，計程車後門是自動開關，你無須自己動手只要等著駕駛員打開車門就可以了。
☆日本的出租車價格並不便宜，可以用昂貴來形容，大多數的日本本地人也都因為價格昂貴盡量選擇電車搭乘，但除了東京和大阪外，小城市如沖繩那霸等較偏僻的地方，出租車價格相對低廉，選擇出租車的時候可以考慮幾個人拼車會相對劃算。另外，東京已經開通了uber服務，在短途的交通需求上可以考慮使用該服務節省時間。
