對外交通
台灣與澎湖本島之間的交通有航空與海路兩種，班次密集，七、八月旅游旺季，機票幾乎都被旅行社預訂一空，因此若自行前往得提前二個月預訂。
航空
1．台北、台中、嘉義、台南、高雄、屏東等地都有班機往來馬公機場，高雄還有班機直飛七美及望安。
2．各航空公司航線如下：台北←→馬公有遠東、復興、立榮；台中←→馬公有華信、立榮；嘉義←→馬公有復興、立榮、遠東、華信；高雄←→七美有華信、立榮航空；高雄←→望安有立榮；馬公←→七美有立榮及華信航空。
3．機場至馬公市區可搭乘公車或計程車，後者車資約350~400元，若事先向車行叫車，則在300元上下。
海運
嘉義、高雄兩地分別有船班往來澎湖；海王星號/嘉義（布袋）←→鎖港，航程約90分鐘，此航線冬季停航；台華輪/高雄←→馬公，航程約4小時。
島際交通
馬公與望安、七美之間有固定交通船往來，其余離島則有私人經營的船班。
陸上交通
澎湖本島有公車行駛，但班次不多，加上島內公路網簡明易行，路況極佳，一般游客多租汽機車或包計程車代步。其中，本島風景線從馬公市出發，先經風櫃，到林投公園、果葉村，再至白沙、通梁古榕、跨海大橋、西嶼等地，全程約74.5公裡。若想租車，須備身份證及駕照，馬公市區租車行林立；欲知公車詳細路線可洽澎湖縣公共車船管理處，包車則可洽計程車同業公會（06）927-6742。每周六及周日車管處會發四班旅游公車，停留地點包含馬公機場、澎湖水族館、北海游客服務中心、通梁風景區、西嶼西台古堡，惟班次不多，最好先電洽發車時間。
