電車是東京市內主要的交通工具，東京也是JR山手線上的5大樞紐換乘站之一。綠色的JR山手線是東京市民最常用的線路之一，該線路環繞東京市中心運行，環城一周大約需要1個小時，是一條包括了東京所有主要城市中心的環線。山手線的車次很多，運行間隔為2～6分鐘，連接東京、上野、池袋、新宿、澀谷、品川等樞紐站，十分方便。山手線有內環和外環之分，由東京火車站經品川開往澀谷方向（順時針方向轉）為外環線，由東京經上野開往池袋方向（逆時針方向轉）的為內環線。
TIPS:東京都內交通系統既方便又復雜。但只要注意觀察車站內醒目的換乘標志，按標志牌指明的方向行進，既可順利完成換乘。東京的各條電車路線均用不同顏色來表示，識別顏色是換乘的要點之一。換乘標志一般均用日語（漢字）和英語兩種文字來表示。有疑問時可向身著制服的車站工作人員詢問。
東京的地鐵線由兩家公司運營，分別為帝都高速交通財團運營的地鐵（營團）和由東京都交通局運營的地鐵（都營）。2004年4月1日營團公司化，東京都交通局改名為“東京地下鐵股份有限公司（東京地下鉄株式會社）”，所經營的路線也改稱為“東京地下鐵線（東京メトロ線）”，不過東京人還是習慣稱之為“營團線”。
現在，在東京都內運行著的是營團下屬的8條線路和都營下屬的 4條線路，共計12條。這些線路中有很多都與JR及私營鐵路相互聯接，它們不只在東京都內運行，前往近郊的城市也十分便捷。特別是山手線以內以及銀座和下町附近的地區，形成了密集的交通網。各線路主要運行區間請參考以下表格：
票價：營團地鐵：6公裡以內160日元，隨後依乘車距離依次遞增為190日元，230日元，270日元，300日元。東京地鐵管理非常嚴格，運行准時，每條線路都有指定的醒目標志顏色，在換乘車時，只要記住各條線的標志色，便可順利地完成換乘。
都營地鐵：4公裡以內170日元，隨之遞增為210日元，260日元。
運營時間：每天5：00－凌晨1：00（高峰期每三分鐘一班；非高峰期每10分鐘一班）；新年全天24小時運營
TIPS:
如果在前往目的地的途中需在營團地鐵和都營地鐵之間轉乘，則可享受低於雙方地鐵合計車費40日元的優惠。地鐵車票一律用自動售票機購買。這種售票機基本上與JR按鍵式售票機相同。但在與JR及私有鐵路聯接的地鐵線路的各站點上，也有一種必須先按“目的地站鐵路公司種類”鍵，再按金額鍵的自動售票機。另外，營團地鐵為了覆蓋東京都中心部的所有車站，在票價為160日元及190日元2類的行駛區間內，使用了一種無需按鍵確認，只將錢幣投入，就能取得相應車票的自動售票機。
