澎湖的對外空運交通均屬方便，但遇到假日及寒、暑假時，機票就比較難買，尤其熱門時段的機票都被旅行社所包走了，常造成機票一票難求。因此打算到澎湖自由行的網友們可於出發前1~2個月到航空公司訂位，訂位不用錢，又可確保行程，建議各位多加利用。
另外你也可以上網至Ezfly的網站上訂購預購票(價格較低)，Ezfly開放訂購二個月前的機票(譬如說：6月1日的機票，可以在4月1日時上網訂購)，但訂購後需立即付款，建議你在訂購機票前先確認人數及出發、回程時間。
若您真的無法成行時，還可於出發前打電話至Ezfly客服中心(02-81712913)辦理退票，不過需扣除15%~25%不等的手續費 。(注：Ezfly是可以退票的，詳情可參考Ezfly退票需知)
航線
航空公司
飛行時間 / 班次
聯絡電話
台北--馬公
(費用：1600~1900)
遠東
復興
立榮
約50分鐘
(每天約有30~40多個航班)
遠東航空公司
台北 / (02)3393-5388
高雄 / (07)337-1388
馬公 / (06)924-9388
立榮航空公司
台北 / (02)2518-5166
高雄 / (07)791-1000
馬公 / (06)922-8999
台中 / (04)2615-5199
嘉義 / (05)286-2363
台南 / (06)260-2811
復興航空公司
台北/ (02)2972-4599
高雄/ (07)335-9355
馬公/ (06)922-8888
華信航空公司
台中 / (04)4254236
馬公 / (06)9228688
德安航空公司
高雄/ (07)8014711
高雄--馬公
(費用：1300~1568)
遠東
復興
立榮
約30分鐘
(每天約有30~40多個航班)
台中--馬公
(費用：1250~1610)
立榮
華信
約30分鐘
(每天約有15~26個航班)
嘉義--馬公
(費用：1370~1569)
立榮
約30分鐘
(每天有2~4個航班)
台南--馬公
(費用：1350~1562)
立榮
約30分鐘
(每天有4~8個航班)
馬公--七美
（費用：561~1028)
德安
約15分鐘
(每天有1個航班)
七美--高雄
(費用：1086~1754)
德安
約35分鐘
(每天有2個航班)
