航空
金門機場，目前可從台北、台中、嘉義、台南、高雄等五地飛往金門，自台灣至金門約需45-50分鐘的航程。每年的三月到四月間，機場常因霧氣圍繞而被關閉。飛金門航空公司：遠東、立榮、復興。金門機場亦是政府開放小三通的重要轉運據點，旅客購買小三通的票，各家航空公司都會幫乘客以游覽車接送到金門的水頭碼頭，大約歷時15-20分鐘，然後，再由水頭碼頭搭船前往廈門。
水運
金門快輪往返高雄金門，由高雄港碼頭開船到金門料羅碼時間約8到9個鐘頭。船票全價約900元。一個月僅一到兩個航次，由於開船時間不定，欲搭船者需事先訂購船票，搭船時請攜帶身分證。
小三通航線：金門有料羅與水頭兩商港，水頭商港同時為小三通指定港口，與廈門和平碼頭間有定期航線，亦為烈嶼鄉（小金門）與金門本島間定期航線對口。 但只對台胞、台商等人群開放。小金門的九宮碼頭及大金門的水頭碼頭之間每天從早到晚每半小時各有兩艘渡輪來回，其中一輛可載運機車。
每隔1 小時廈門與金門對開 1 航班。航班時刻分為夏季航班和冬季航班。夏季航班首班開航時間為早上 8：30 ，末班為 17：30 ；冬季航班首班開航時間為早上 9：00 ，末班為 18：00 。 航程40分鐘左右，票價180元人民幣。
“泉金”航線目前每天有 1 個航班（ 2 個航次）往返兩岸，可提供往返 496 個座位。泉州石井港往金門開船時間為： 8：50 ；金門往泉州石井港開船時間為： 15：20 。
